Design de l'étude

Design de l'étude

Cadre de gestion

Le cadre de gestion contient les règles et procédures de fonctionnement de la Biobanque québécoise de la COVID-19 (BQC19) et est disponible dans la section « documents disponibles ». 

Accès au matériel biologique et aux données

L'accès à du matériel biologique et à des données de haute qualité provenant de patients infectés et non infectés par SARS-CoV-2 est absolument essentiel pour mieux connaître les déterminants de COVID-19. Les échantillons collectés étant une ressource précieuse, limitée et non renouvelable, les demandes d’accès seront étudiées de façon rigoureuse afin de d’optimiser (maximiser) leur utilisation et d’assurer que les analyses proposées sont pleinement justifiées et auront un impact potentiel important sur l’avancement de la recherche sur la COVID-19. Tout le matériel biologique collecté sera traité par l’un des établissements participants à la BQC19 selon les Modes opératoires normalisés de l’établissement pour assurer une conservation optimale. Ces procédures nécessitent également que les données cliniques requises soient liées informatiquement aux prélèvements dans l’application de gestion de données BTRSRV2 et que la gestion et l’inventaire soient maintenus à jour dans BTRSRV2.

Les données et les connaissances scientifiques sont des biens communs et doivent être partagées dans un cadre approprié. La BQC19 souscrit pleinement aux principes énoncés dans la Déclaration de la fondation Wellcome (mars 2020) portant sur le partage des données et découvertes issues de la recherche sur la COVID-19 “Sharing research data and findings relevant to the novel coronavirus (COVID-19) outbreak” disponible sur: https://wellcome.ac.uk/press-release/sharing-research-data-and-findings-relevant-novel-coronavirus-covid-19-outbreak. La COVID-19 représentant une menace importante et urgente pour la santé mondiale, la BQC19 s’engage à veiller à ce que les résultats de la recherche effectuée avec ses ressources et les données relatives à cette épidémie soient partagés rapidement et ouvertement afin d'informer la réponse de santé publique et de contribuer à sauver des vies.

Plus précisément, et en accord avec l’énoncé du Wellcome Trust :

  • Les données seront partagées aussi rapidement et aussi largement que possible avec la communauté scientifique, la santé publique et l’OMS, ainsi que les protocoles et les standards utilisés dans la collecte de données
  • Toutes les publications de recherche revues par les pairs et qui sont pertinentes à la pandémie actuelle seront immédiatement mises à disponibilité en « Open Access » ou accessibles gratuitement au moins pendant la durée de la pandémie.

Les chercheurs qui obtiennent l'accès aux données et aux échantillons de la BQC19 devront fournir une copie de leurs données dérivées à la BQC19, conformément à l'entente de transfert mise en place. La nature exacte des données dérivées et le délai dans lequel elles doivent être fournies seront déterminés au cours du processus d'examen et seront inclus dans l'entente de transfert. Ces données dérivées feront partie intégrante des données de recherche de la BQC19 et seront mises à la disposition d'autres chercheurs qui accèderont à l’avenir à la BQC19, leur permettant ainsi l’accès à ces données enrichies.

Les chercheurs utilisant le matériel biologique et les données de la BQC19 devront mentionner dans leurs communications scientifiques (écrites et orales) que le matériel ou les données utilisés ont été obtenus de la BQC19. Ils devront également mentionner l’apport financier du Fonds de recherche du Québec-Santé (FRQS), de Génome Québec et de l’Agence de la santé publique du Canada. Lorsque leurs communications auront été publiées, ils devront transmettre au gestionnaire de la BQC19 une copie des publications et des documents y faisant référence, par exemple des communiqués de presse. Toute entente de transfert de matériel biologique ou de données inclura les dispositions nécessaires à cet effet.

Matériel disponible

Matériel disponible (présentement)
Chez l'adulte
Extrait ARN (provenant de tube PAXgene)
Sang complet
Extrait ADN (provenant de sang complet sur ACD)
Plasma (provenant de tubes ACD)
PBMC (en quantité extrêmement limitée)
Sérum 
Chez l'enfant
Extrait ARN (provenant de tube PAXgen)
Sang complet
Extrait ADN (provenant de sang complet sur ACD)
Plasma (provenant de tubes ACD)
PBMC (en quantité extrêmement limitée)
Sérum 
Urine (possible)
Selles
Prélèvement nasal (possible)
Matériel disponible (à venir)
Chez la femme enceinte (en quantité très limitée)
Prélèvements vaginaux
Liquide amniotique
Sang de cordon
Lait maternel

Données cliniques

    Hospitalisé   Suivi post-congé hospitalier
  Arrivée J0 J2 J7 J14 J30 Congé 1M 3M 6M 12M 18M 24M
Participant                          
Sexe à la naissance                        
Pays de naissance                        
Statut vital
Date du dernier statut vital connu
Date du décès
Heure du décès
Lieu du décès
Cause du décès
Participant pédiatrique                          
Enfant de moins d'un an                        
Poids à la naissance                        
Gestation                        
Volet pédiatrique                          
Patiente enceinte ?                        
Date d'accouchement prévue                        
Post partum (accouchement dans la dernière année)                        
Résultat de la grossesse                        
Date d'accouchement                        
Statut COVID du bébé                        
Bébé testé pour les pathogènes infectieux de la mère                        
Résultat                        
Méthode                        
Type de participant                          
Type de participant                        
Diagnostic principal (ou primaire) relatif à l'hospitalisation                        
Est-il un travailleur du milieu de la santé                        
Est-il un travailleur dans un laboratoire de microbiologie                        
Vit                        
Vit avec                        
Données démographiques                          
Âge au moment de la visite
Taille                        
Poids                        
IMC                        
Tabagisme et consommation de drogues                          
Statut tabagique                        
Cigarette électronique                        
Commentaire sur le tabagisme                        
Usage de drogues                        
Type de drogue                        
Signes vitaux et évaluation quotidienne                          
Température              
Fréquence respiratoire              
Fréquence cardiaque              
Saturation d'O2 à l'air ambiant              
Oxygénothérapie              
Saturation d'O2 en oxygénothérapie              
FiO2              
Pression systolique / diastolique              
Échelle AVPU                
Score de Glasgow (GCS/15)                
Flot urinaire en 24h                
Symptômes documentés                          
Asymptomatique            
Date d'apparition de(s) premiers(s) symptômes            
Fièvre            
Maux de gorge            
Toux            
Dyspnée            
Hémoptysie/Sang dans l'expectoration            
Rhinorrhée            
Pharyngite            
Mal d'oreilles            
Arthralgie            
Fatigue            
Douleur thoracique            
Douleur abdominale            
Myalgie            
Respiration sifflante            
Nausée / vomissement            
Maux de tête            
Confusion            
Diarrhée            
Convulsions            
Conjonctivite            
Démangeaisons de la peau            
Anorexie            
Oedème des jambes            
Trouble de la parole (Aphagie/dysphasie)            
Perte du goût/perte de l'odorat            
Faiblesse ou engourdissement aux extrémités            
Antécédents médicaux                          
AVC antérieur                        
Accident ischémique transitoire (AIT) antérieur                        
Fibrillation auriculaire ou flutter                        
Autre problème neurologique (autre que AVC/AIT)                        
Infarctus du myocarde antérieur                        
Maladie coronarienne                        
Insuffisance cardiaque                        
Fraction d'éjection du ventricule gauche de base pré-hospitalisation                        
Autre problème cardiaque chronique                        
Maladies hématologiques chroniques                        
Diabète                        
Obésité                        
Hypertension                        
Asthme                        
Problèmes rhumatologiques                        
Problèmes rénaux chroniques                        
Dialyse                        
MPOC: Bronchite chronique, emphysème                        
Sévérité de la MPOC                        
Hypertension pulmonaire                        
Autres problèmes pulmonaires chroniques                        
Démence                        
Problèmes psychiatriques                        
Maladie hépatique chronique                        
Malnutrition                        
Cancer                        
Type de cancer                        
Avec métastase(s)                        
Sous traitement actuellement                        
HIV                        
Immunosupprimé                        
Autres antécédents med.                        
Médication prise à la maison                          
Inhibiteurs de l'enzyme de conversion                        
Antagoniste des récepteurs de l'angiotensine
Stéroïdes systémiques                        
Anticoagulants                        
Colchicine                        
Autre médication immunosuppressive                        
Analyses de laboratoire                          
Décompte des globules blancs   max            
Décompte des Neutrophiles   max            
Décompte des Lymphocytes   min            
Décompte des Monocytes   max            
Décompte des Éosinophiles   max            
Décompte des Basophiles   max            
Décompte des plaquettes   min            
Mesure de l'hémoglobine   min            
Urée   max            
Créatinine   max            
NT-proBNP   max            
BNP   max            
Sodium Na+   max            
Potassium K+   max            
Protéine C-réactive (CRP)   max            
LDH   max            
CPK (CK)   max            
Albumine   min            
AST   max            
ALT   max            
Procalcitonine (PCT)   max            
Troponine T hs   max            
Troponine I hs   max            
Troponine T   max            
Troponine I   max            
APTT   max            
International Normalized Ratio (INR)   max            
Triglycérides   max            
Bilirubine totale   max            
Bilirubine directe (conjuguée)   max            
Glucose   max            
Lactate Veineux   max            
D-Dimère   max            
Fibrinogène   max            
Ferritine   max            
IL-6   max            
CD4   min            
CD8   min            
Support                          
Support respiratoire              
Oxygénothérapie par canule / masque              
Support non invasif par LNHD              
Support non invasif CPAP/BPAP              
Support invasif avec ventilation mécanique              
Nombre de jours sous ventilation mécanique                        
SpO2 (plus basse associée avec le support le plus élevé)              
FiO2 (en lien avec SpO2)              
Thérapie de support              
Vasopresseurs / inotropes              
Nombre de jours sous                        
Positionnement ventral              
iNO              
ECMO              
Support invasif HFOV (High-frequency oscillatory ventilation)              
Trachéostomie              
Transfusion de produits sanguins              
Agents neuro-bloquants              
Dialyse / hémofiltration              
Autre, préciser              
Score de fragilité                          
Score de fragilité   *        
Résumé hospitalier                          
Date et heure de l'arrivée à l'hôpital                        
Visite à l'urgence seulement                        
Est-ce un transfert d'un autre établissement ?                        
Nom de l'établissement                        
Si transféré d'un autre hôpital, date d'admission initiale                        
Date d'admission aux soins intensifs                        
Date de congé des soins intensifs                        
Date de congé de l'hôpital                        
Disposition                        
Statut lors du congé                        
Si COVID positif, quel est le degré de sévérité (selon WHO) le plus sévère atteint?                        
Habilité à prendre soin de soi au moment du départ de l'hôpital vs pré-COVID                        
Dernier niveau de soin                        
Diagnostic COVID et test de pathogènes                          
Date du test diagnostic pour COVID19                        
Résultat                        
Type d'échantillon                        
Autres infections virales documentées durant l'hospitalisation                        
Adenovirus                        
Influenza                        
RSV                        
Parainfluenza                        
Rhinovirus / Enterovirus                        
Metapneumovirus                        
Autre, préciser                        
Autres infections bactériennes documentées durant l'hospitalisation                        
Complications durant l'hospitalisation                          
SDRA                        
Spécifier la sévérité                        
Pneumonie bactérienne                        
Pneumonie virale                        
Bronchiolite                        
Pneumonie organisée cryptogénique (POC)                        
Embolie pulmonaire                        
Thrombose veineuse profonde (DVT)                        
Pneumothorax                        
Épanchement pleural                        
Fonction ventriculaire gauche                        
LVEF                        
Insuffisance cardiaque décompensée                        
Myocardite                        
Endocardite                        
Péricardite                        
Fibrillation auriculaire(FA)/Flutter                        
Fibrillation/Tachycardie ventriculaire                        
Autre type d'arythmie cardiaque                        
Spécifier                        
Arrêt cardiaque                        
Ischémie cardiaque STEMI                        
Ischémie cardiaque NSTEMI                        
Accident vasculaire cérébral                        
Pancréatite                        
Accident ischémique transitoire                        
Convulsions                        
Méningite / Encéphalite                        
Rhabdomyolyse / myosite                        
Trouble de la coagulation                        
coagulation intravasculaire disséminée
Bactériémie                        
Anémie                        
Hémorragie gastro-intestinale                        
Dysfonction hépatique                        
Insuffisance rénale aigue                        
Hyperglycémie                        
Hypoglycémie                        
Autre                        
Spécifier                        
Autres tests effectués durant l'hopitalisation                          
Radiographie des poumons                        
Tomodensitométrie thorax                        
Tomodensitométrie de l'abdomen                        
Tomodensitométrie de la tête                        
ECG                        
Échographie au point d'intervention (POCUS)                        
Échocardiogramme                        
Échographie cardiaque
Angiographie coronarienne (Cathétérisme cardiaque)                        
Intervention coronarienne percutané(stent)                        
Autres tests d'imagerie                        
Médication durant l'hospitalisation                        
Remdesivir                        
Ribavirin                        
Lopinavir/Ritonavir ("Kaletra")                        
Interferon alpha                        
Interferon beta                        
Neuraminidase inh                        
Autre antiviral                        
Préciser                        
Azithromycin ("Zithromax")                        
Autre antiobiotique                        
Antifongique                        
Corticostéroide systémique                        
Hydroxychloroquine ("Plaquenil")                        
Chloroquine ("Aralen")                        
Ivermectin ("Stromectol")                        
Tocilizumab ("Actemra")                        
Sarilumab ("Kevzara")                        
Kineret ("Anakinra")                        
Autre immunomodulateur                        
Colchicine                        
Plasma convalescent                        
Cellules souches / cellules T éduquées                        
IVIG                        
Autre traitement pour COVID-19                        
Suivi                          
Visite à l'hôpital suite au congé              
Date admission              
Établissement              
Cause              
Statut fonctionnel                          
Mobilité              
Soins personnels              
Activités habituelles              
Douleur et inconfort              
Anxiété et dépression              
Essoufflement              
État de santé              
Quelle difficulte éprouvez-vous ...                          
à soulever ou porter une charge de 10 lbs?              
à marcher à travers d'une piece?              
à transférer d'une chaise a un lit?              
à monter 1 étages à pied?              
Combien de fois êtes-vous tombé dans la dernière année?